A história do filme mostra que após Okabe ter se esforçado ao máximo até chegar em uma determinada linha do tempo ideal, passando por diversas linhas ao longo do caminho, para salvar Mayuri e Kurisu (mais conhecida pelos fãs como Christina), ele começa a ter sua própria existência negada nesta realidade. Desta forma, Kurisu é quem passa a lutar para mantê-lo.